Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FMODQ06828 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FMODQ06828 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FMODQ06828 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FMODQ06828 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms