Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CD164Q04900 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CD164Q04900 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms