Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN2Q02246 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN2Q02246 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms