Protein–RNA interactions for Protein: P98153

DGCR2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR2P98153 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DGCR2P98153 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DGCR2P98153 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DGCR2P98153 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DGCR2P98153 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DGCR2P98153 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DGCR2P98153 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms