Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms