Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
ROMO1P60602 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
ROMO1P60602 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -1
ROMO1P60602 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
ROMO1P60602 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ROMO1P60602 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
ROMO1P60602 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ROMO1P60602 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ROMO1P60602 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ROMO1P60602 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
ROMO1P60602 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms