Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIPPLY3P57055 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms