Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2A2P52657 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms