Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPGP40121 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPGP40121 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPGP40121 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPGP40121 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPGP40121 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms