Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2IP36954 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms