Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK11BP21127 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms