Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EGR1P18146 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EGR1P18146 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EGR1P18146 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EGR1P18146 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EGR1P18146 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EGR1P18146 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EGR1P18146 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EGR1P18146 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms