Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BMP3P12645 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BMP3P12645 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BMP3P12645 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BMP3P12645 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BMP3P12645 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP3P12645 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP3P12645 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP3P12645 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BMP3P12645 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms