Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGA5P08648 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA5P08648 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms