Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms