Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD74P04233 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD74P04233 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD74P04233 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms