Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms