Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLOCKO15516 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms