Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms