Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM5B3KS81 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms