Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM90A7PA6NKC0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM90A7PA6NKC0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms