Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA3Q9Y6H8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms