Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CIZ1Q9ULV3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms