Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSEQ9UL01 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms