Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHIC2Q9UKJ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms