Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN2Q9UHV9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms