Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms