Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms