Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMT1Q9NXH9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms