Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CWC25Q9NXE8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms