Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCLQ9NW38 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCLQ9NW38 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms