Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB4Q9NTQ9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms