Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6BQ9NRW1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms