Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN4Q9NRL3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN4Q9NRL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms