Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TULP4Q9NRJ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TULP4Q9NRJ4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms