Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ARSK-205ENST00000513814 1958 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.357e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TMCC2-206ENST00000481950 2674 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SLC13A3-203ENST00000372121 848 ntTSL 517.16■□□□□ 0.349e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN1-204ENST00000526494 399 ntTSL 417.13■□□□□ 0.337e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CORO7-217ENST00000572666 1237 ntTSL 517.13■□□□□ 0.339e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.337e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.337e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CPT1B-213ENST00000497224 806 ntTSL 317.08■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ITPR1-213ENST00000481415 552 ntTSL 417.08■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ARSK-203ENST00000504873 1920 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 COX6A1-203ENST00000550009 572 ntTSL 217.05■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-204ENST00000398207 876 ntTSL 517.01■□□□□ 0.317e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 HPRT1-202ENST00000462974 724 ntTSL 317■□□□□ 0.317e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 416.95■□□□□ 0.37e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.37e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SLC35B4-202ENST00000416907 1379 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 516.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 HOOK2-214ENST00000589915 264 ntTSL 216.88■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DNAJB2-213ENST00000477917 4487 ntTSL 216.87■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MUM1-202ENST00000585399 425 ntTSL 216.81■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PGS1-206ENST00000586510 567 ntTSL 516.79■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ENTPD6-208ENST00000427553 451 ntTSL 316.76■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SUCLG2-202ENST00000460567 1596 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.269e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CERCAM-207ENST00000463535 1205 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-206ENST00000470769 1215 ntTSL 216.64■□□□□ 0.259e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN11-211ENST00000450041 649 ntTSL 516.6■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SKA2-209ENST00000583976 570 ntTSL 216.55■□□□□ 0.247e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.247e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.247e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MLX-206ENST00000588320 2313 ntTSL 516.48■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEURL4-211ENST00000574120 936 ntTSL 516.35■□□□□ 0.219e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SF3A3-203ENST00000461869 776 ntTSL 316.34■□□□□ 0.215e-11■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CANT1-209ENST00000591625 599 ntTSL 416.29■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-224ENST00000625103 371 ntTSL 316.29■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EFTUD2-214ENST00000589769 689 ntTSL 316.27■□□□□ 0.29e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 416.2■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C10orf128-204ENST00000374156 2070 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 STAT1-211ENST00000464072 865 ntTSL 216.18■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GAS8-203ENST00000537797 1080 ntTSL 216.15■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE19-212ENST00000567756 571 ntTSL 316.15■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 STAT1-209ENST00000452281 2594 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.187e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.177e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-211ENST00000581698 471 ntTSL 316.09■□□□□ 0.179e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 STRADA-223ENST00000584110 563 ntTSL 416.04■□□□□ 0.163e-17■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 STRADA-215ENST00000580288 540 ntTSL 516.03■□□□□ 0.163e-17■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.159e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NEURL4-213ENST00000576794 833 ntTSL 515.99■□□□□ 0.159e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C10orf128-206ENST00000470884 588 ntTSL 215.97■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PUF60-212ENST00000528320 922 ntTSL 215.94■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-208ENST00000478481 564 ntTSL 215.94■□□□□ 0.149e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PGS1-215ENST00000592043 988 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ECE1-211ENST00000527991 580 ntTSL 415.93■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SPOCD1-203ENST00000452755 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.92■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF185-207ENST00000436731 2120 ntTSL 515.85■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TTC7A-209ENST00000484061 3085 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC28-213ENST00000559399 892 ntTSL 315.8■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SELENBP1-202ENST00000423070 1887 ntTSL 515.76■□□□□ 0.117e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-204ENST00000467560 567 ntTSL 215.72■□□□□ 0.119e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE19-211ENST00000566767 617 ntTSL 215.71■□□□□ 0.117e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.17e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF736-204ENST00000465343 1027 ntTSL 315.51■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ASF1A-202ENST00000511766 573 ntTSL 215.48■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF468-207ENST00000602144 571 ntTSL 315.44■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SPOCD1-212ENST00000531039 581 ntTSL 515.37■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RMDN3-205ENST00000558364 582 ntTSL 215.36■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SPOCD1-209ENST00000528579 765 ntTSL 215.28■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TLE2-206ENST00000586492 331 ntTSL 515.28■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 186.3
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