Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLIRPQ9GZT3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms