Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CADM1Q9BY67 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CADM1Q9BY67 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms