Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPL3Q9BY60 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms