Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms