Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USB1Q9BQ65 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms