Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC85AQ96PX6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms