Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JSRP1Q96MG2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JSRP1Q96MG2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms