Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC17Q96LX7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms