Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HPS3Q969F9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms