Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCOLN3Q8TDD5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCOLN3Q8TDD5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms