Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC63Q8NA47 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms