Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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CLIP4Q8N3C7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLIP4Q8N3C7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLIP4Q8N3C7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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