Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37DQ86XT2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms