Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRSAM1Q6UWE0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms